摘要：利用85个SSR标记，对大豆育成品种群体（190份代表性材料）的基因组进行扫描，在检测群体结构基础上搜索连锁不平衡位点，并采用TASSEL软件的GLM方法对11个大豆农艺性状QTL进行关联分析。结果表明：（1）在公共图谱上共线性或非共线性的SSR位点组合均广泛存在连锁不平衡（LD），但不平衡程度D’〉0．5的组合数只占总位点组合的1．71％，共线位点D值随遗传距离衰减较快；（2）SSR数据遗传结构分析表明，育成品种群体由7个亚群体组成，矫正后全群体共有45个位点累计136个位点（次）与11个大豆农艺性状QTL关联，其中22个位点（次）与家系连锁定位的QTL区间相重，有43个位点（次）2年重复出现；（3）一些标记同时与2个或多个性状关联，可能是性状相关或一因多效的遗传基础；（4）育成品种群体关联位点与地方品种群体和野生群体只有少数相同，群体间育种性状的遗传结构有相当大差异；（5）发掘出农艺性状优异等位变异及其载体品种，包括增效最大的产量等位变异Satt347-300（＋932kg hm^-2，中豆26），生物量等位变异Satt365．294（＋3123kg hm^-2，黄毛豆），蛋白质含量等位变异Be475343—198（＋0．41％，淮豆4号），脂肪含量等位变异Satt150-273（＋2．32％，科丰15）等。在此基础上作了设计育种的探讨。

关键词：大豆育成品种 农艺性状 ssr标记 关联分析 优良等位变异 

单位：南京农业大学大豆研究所/国家大豆改良中心/作物遗传与种质创新国家重点实验室; 江苏南京210095; 滨州职业学院; 山东滨州256603