摘要：以茶树品种龙井43幼根为材料，构建cDNA文库并测序，获得4833条EST序列，拼接后得到3482条无冗余EST，总长2290 kb。对其进行SSR搜索，共检测到577个SSR位点，分布于500条茶树幼根EST中，其中含有EST-SSR的序列占14.36%，平均每3.97 kb出现一个SSR。利用Primer premier 5.0，对含有SSR的EST设计引物416对, 通过退火温度和多态性筛选，确定可用的引物及其最佳退火温度，并从筛到的引物中选取63对及1对已发表引物作为核心引物，对浙江省茶树地方品种和选育品种进行遗传多样性和遗传结构分析。结果显示64对引物均在供试材料中表现出多态性，共检测到232个等位位点，平均每对引物3.6个；每对引物可鉴定的基因型为2～13个，平均4.3个。供试材料多态性信息量（PIC）介于0.02～0.84，平均0.44；扩增位点的观测杂合度平均为0.44，期望杂合度平均为0.48。地方品种的遗传多样性水平略高于选育品种（系）。不同地方资源群体多态性信息量为0.24～0.36，举岩群体的多样性最高，惠明群体的多样性最低。浙江各地区以杭州资源的多态性最高，PIC达0.41；丽水的多态性最低，PIC为0.24。Structure 2.2群体结构分析和UPGMA聚类分析表明，地方品种、选育品种（系）具有相对独立的群体结构，选育品种（系）根据亲缘关系的不同形成不同的类群。

关键词：茶树 遗传多样性 遗传结构 

单位：中国农业科学院茶叶研究所茶树资源与改良研究中心/国家茶树改良中心; 浙江杭州310008