摘要：利用自然群体进行关联分析是检测目标性状QTL、揭示其遗传基础的有效方法。对国内黄淮和南方地区和东亚、东南亚、南亚291份大豆品种幼苗期耐淹性和64个SSR标记的关联分析结果表明,整个群体由国内和国外2个不同的亚群体组成,2个亚群均存在连锁不平衡。在群体1（国内）中分别检测到相对死苗率、相对失绿率、相对萎蔫率的关联位点3、7和12个,群体2（国外）中相应位点6、3和5个;多个位点兼与2个或者3个耐淹性状关联;部分关联位点与连锁定位结果一致。在2个群体中分别筛选出3个耐淹性状减效最大（最耐淹）的优异等位变异24个和22个。相对死苗率优异等位变异在黄淮、南方地区5个主要系谱中分布不同,育种轮次间有波动。结合基因型和耐性表现,从国内材料中优选出合豆2号、黔豆3号、诱变31、南农493-1,从国外材料中优选出PI208432、PI377576、PI481690等耐淹载体材料,为耐淹育种奠定材料和标记辅助选择育种的基础。

关键词：大豆品种 耐淹性 ssr标记 关联分析 优异等位变异 

单位：南京农业大学大豆研究所/国家大豆改良中心/作物遗传与种质创新国家重点实验室; 江苏南京210095; 滨州职业学院; 山东滨州256603