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大豆胞囊线虫主效抗病基因Rhg4(GmSHMT)的CAPS/dCAPS标记开发和利用

史学晖 李英慧 于佰双 郭勇 王家军 邱丽娟 作物学报 2015年第10期

摘要:大豆胞囊线虫(soybeancystnematode,SCN)严重危害世界大豆生产,Rhg4(resistancetoHeteroderaglycines4)是控制大豆SCN抗性的2个主效位点之一。本研究针对Rhg4(GmSHMT)上的2个单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphisms,SNP)位点开发了快速、经济、简便易行的CAPS(Rhg4-389)和dCAPS标记(Rhg4-1165),并用开发的2个标记鉴定了以大豆胞囊线虫应用核心种质为主的193份代表性抗感种质。结果表明,Rhg4-389和Rhg4-1165位点间存在显著连锁不平衡(P=0.0001,r2=0.87),可形成4种单倍型。Rhg4-389-G/Rhg4-1165-T和Rhg4-389-C/Rhg4-1165-A为优势单倍型,稀有单倍型Rhg4-389-G/Rhg4-1165-A和Rhg4-389-C/Rhg4-1165-T是在中国抗源中新发现的单倍型。结合193份种质对SCN3号小种抗性鉴定分析发现,Rhg4-389-G和Rhg4-1165-T主要存在于抗病种质,它们形成的单倍型对抗病种质鉴定效率可达94.1%。本研究开发了可用于辅助大豆SCN抗性鉴定且方便育种家利用的CAPS/dCAPS标记,且用其摸清了应用核心种质等重要抗源在Rhg4位点的“本底”,为育种家有效利用这些优异抗源提供了重要信息。

关键词:大豆胞囊线虫rhg4单倍型分子标记辅助选择

单位:农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程/农业部北京大豆生物学重点实验室/中国农业科学院作物科学研究所 北京100081 黑龙江省农业科学院大豆研究所 黑龙江哈尔滨150086

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