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野生小豆和栽培小豆microRNA全基因组鉴定与比较分析

马燕明; 陈春海; 杨凯; 李奕松; 赵波; 李江; 李永强; 万平 作物学报 2016年第09期

摘要:MicroRNA(miRNA)是一种非编码的小RNA分子,对真核生物基因表达起着非常重要的调控作用,miRNA系统鉴定对于研究其功能及作用机制具有重要意义。本研究分别以栽培小豆京农6号(JN6)和野生小豆CWA108为试验材料,进行了深度miRNA测序。系统鉴定和注释这2个物种的miRNA,并分析了其miRNA种类的异同、表达量的差异和靶基因在功能富集上的差别。鉴定出了JN6和CWA108共有和特有的miRNA,明确了它们之间差异表达的miRNA,以及这些特有和差异miRNA的靶基因在功能富集上的差异,发现可能和抗病与抗逆途径相关。

关键词:mirnaangularis

单位:北京农学院/北京农业应用新技术北京市重点实验室; 北京102206; 深圳华大基因科技有限公司; 广东深圳518083

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