线上期刊服务咨询,发表咨询:400-808-1701 订阅咨询:400-808-1721

生物序列模体的混合Gibbs抽样识别算法

刘立芳; 霍红卫; 王宝树 电子学报 2008年第04期

摘要:针对生物序列模体的识别问题,提出了一个新的混合Gibbs抽样识别算法.算法基于混合模体模型学习,采用贪心策略,通过似然度最大化,逐次将新的模体加入到混合模型中.算法中设计了位点抽样和模体抽样两种抽样方法,这两种抽样方法交替进行.为了加速搜索过程,对输入数据集采用了基于kd—trees的分层划分策略.实验结果表明,该算法对序列家族大量模体特征的识别具有显著优势,并且可建立更具统计特征的模体模型,从而提高序列分类的准确性.

关键词:生物信息学模体识别gibbs抽样混合模体模型

单位:西安电子科技大学计算机学院; 陕西西安710071

注:因版权方要求,不能公开全文,如需全文,请咨询杂志社

电子学报

北大期刊

¥1272.00

关注 25人评论|0人关注