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基于基因表达谱的肿瘤预测模型研究

李辉; 王金莲 电子学报 2008年第05期

摘要:本文从肿瘤基因表达谱分析入手,研究并选取胃癌相关标志基因集合,以此集合为基础抽取甄别肿瘤与正常组织的基因分类规则集,进而建立起肿瘤预测模型,首先,以支持向量机为分类器用特征基因集合的样本识别率为适应度函数,采用遗传算法对特征基因进行筛选.然后用决策树抽取特征基因的规则集,结合肿瘤分子生物学文献和生物实验建立肿瘤预测模型.最后通过对胃癌基因表达谱数据的分析,建立了胃癌预测模型,结果表明该模型对胃癌分子生物学实验和临床诊断具有一定的指导意义和参考价值.

关键词:胃癌遗传算法决策树支持向量机

单位:北京工业大学计算机学院; 北京100124; 北京工业大学电控学院; 北京100124

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