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基于Tile自组装模型的最大匹配问题算法研究

周旭 周炎涛 李肯立 欧阳艾嘉 潘果 电子学报 2015年第02期

摘要:Tile自组装模型作为一种重要的DNA计算模型,在解决NP问题时展现出了巨大优势.文中针对现有最大匹配问题DNA计算算法实验操作复杂,错误率高的缺点,提出了一种基于Tile自组装模型的最大匹配问题新算法.算法所需的Tile分子种类为O(mn),所需生物操作数为O(1),计算时间为O(m),计算空间复杂度为O(mn)(其中m为边数,n为顶点数,且O(m)=O(n2)).与现有的最大匹配问题DNA计算算法相比,本算法不仅可靠性更好,而且更具可操作性.

关键词:dna计算tile自组装模型最大匹配问题np完全问题并行计算

单位:嘉兴学院数理与信息工程学院 浙江嘉兴314001 湖南大学信息科学与工程学院 湖南长沙410082 湖南大学电气与信息工程学院 湖南长沙410082

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