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一种基于二叉树的快速穷举化搜索算法

文元桥; 周敬利; 余胜生 计算机工程与科学 2005年第07期

摘要:本文在构造具有方向导向性的完全二叉树的基础上,提出了一种适合研究蛋白质构象的格子模型快速穷举搜索算法.该算法通过使用序列分解、排列分类方法,将复杂度为2m种的CmN次搜索变成复杂度为m种的CmN次搜索,大大提高了利用格子模型搜索蛋白质能量最低构象的速度.同时,由于二叉树良好的方向性,有效地避免了搜索的盲目性.

关键词:格子模型二叉树序列分解构象搜索

单位:华中科技大学计算机科学与技术学院; 湖北; 武汉; 430074; 武汉理工大学航运学院; 湖北; 武汉; 430063; 华中科技大学计算机科学与技术学院; 湖北; 武汉; 430074

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计算机工程与科学

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