摘要：部级农业科研机构是国家科技创新体系的重要组成部分，具有显著的公共性、基础性和社会性，政府投入的强度直接关系到这些公益性科研机构运行经费的保障水平和科技创新能力。本文首先对部级农业科研机构的政府投入总量、投入结构以及不同性质的农业科研机构的政府投入总量和结构的差异进行分析；在此基础上进一步分别从部级农业科研机构的经费支出与政府实际投入差异的维度，从与同级别的中国科学院、全国中央部门属科研机构相比差异的维度，对部级农业科研机构政府投入的缺口进行剖析；最后有针对性地从国家加大投入力度、优化投入结构与投入方向等方面提出政策建议。

关键词：部级农业科研机构 政府投入 基本支出 项目支出 政府投入缺口 

单位：中国农业科学院 北京100081