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人类及9种模式生物中 ORAOV1蛋白的多维度特征分析

马子洋 姚靖歆 周萍 山东医药 2015年第18期

摘要:目的:分析比较口腔癌过度表达序列1( ORAOV1)蛋白在人类与猕猴、大鼠、小鼠、家猫、家犬、金仓鼠、豚鼠、原鸡、非洲爪蟾9种模式生物中的特征,寻找宜用于建立口腔鳞状细胞癌( OSCC)动物模型的模式动物。方法采用生物信息学技术对人类ORAOV1蛋白提取以下特征:氨基酸序列、基本理化性质、亲疏水性、亚细胞定位、立体结构,并与9种模式生物ORAOV1蛋白的上述特征进行比较。结果在9种模式生物中,豚鼠ORAOV1蛋白在氨基酸序列、基本理化性质、亲疏水性、亚细胞定位及立体结构与人类最为接近,最宜于建立OSCC动物模型。结论人类ORAOV1蛋白具有137个氨基酸,位于微体,亲水,性质稳定;豚鼠与人类ORAOV1蛋白各特征相近,最宜用于建立OSCC动物模型。

关键词:口腔鳞状细胞癌口腔癌过度表达序列1蛋白动物模型生物信息学

单位:首都医科大学基础医学院 北京100069 首都医科大学生物医学工程学院

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