摘要：目的基于生物信息学分析胃腺癌组织中微小RNA（miRNA）差异表达情况,寻找可作为胃腺癌生物标记物的miRNA。方法利用癌症基因组图谱（TCGA）数据库下载胃腺癌相关数据集,分析肿瘤组织与正常组织之间miRNA的表达差异。利用Kaplan-Meier曲线进行患者生存分析,筛选具有潜在生物标记物性质（高表达、预后差）的miRNA。利用生物信息学预测miRNA的靶基因,通过基因本体（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）进行基因富集分析,以判定差异基因主要影响的生物学功能或者通路。结果 TCGA数据库分析结果发现,相对于45份正常组织,446份胃腺癌组织中存在319个差异表达miRNA,其中下调95个、上调224个。进一步通过生存分析筛选出6个高表达、与预后有关的miRNA（miR-217、miR-216a、miR-200b、miR-1911、miR-675、miR-96）,其中miR-217高表达者预后差。胃腺癌组织中miR-217表达量为303.2±55.16,高于正常组织中的84.82±13.42（P〈0.001）。通过Targetscan和miRDB生物信息预测软件对miR-217潜在靶基因取交集,获得151个有效靶基因;GO和KEGG分析结果显示,miR-217的这些靶基因与调节细胞凋亡、细胞周期、大分子代谢、蛋白酶的活性密切相关。结论利用生物信息学分析发现,与正常组织比较,胃腺癌组织中存在miRNA的差异表达;其中miR-217在胃腺癌组织中表达上调,通过调控靶基因参与相关的信号通路而导致患者预后不良,可成为胃腺癌的生物标记物。

关键词：胃腺癌 生物信息学分析 癌症基因组图谱 微小rna 靶基因 

单位：中国医科大学药学院; 沈阳110122