线上期刊服务咨询,发表咨询:400-808-1701 订阅咨询:400-808-1721

人源性IGFBP3的生物信息学分析

周大杰; 陈晓玮; 郏雁飞; 张玉洁; 马晓丽 山东医药 2018年第28期

摘要:目的采用生物信息学方法预测人源性胰岛素样生长因子结合蛋白3(IGFBP3)的分子结构和生物学功能。方法从美国生物信息中心获取人源性IGFBP3基因mRNA和蛋白氨基酸序列,利用ORF Finder在线工具分析IGFBP3蛋白开放阅读框,ProtParam预测IGFBP3蛋白的理化性质,Predict-Protein和SOPMA工具预测IGFBP3蛋白的二级结构,SWISS-MODEL预测IGFBP3蛋白的三级结构,Signal P4.1 Server和NLStradamus工具预测IGFBP3蛋白的信号肽和核定位信号,TMHMM软件包分析IGFBP3蛋白的跨膜区,BLAST工具预测IGFBP3蛋白的结构域,String软件预测与IGFBP3蛋白相互作用的蛋白,Gene Ontology Consortium预测IGFBP3蛋白的生物学功能。结果IGFBP3属于不稳定亲水性分泌蛋白,二级结构主要为环状结构和螺旋结构,无跨膜区,包含5个保守结构域,能在细胞核中发挥生物学效应,与MMP2等多种蛋白作用紧密。IGFBP3可参与细胞凋亡、细胞增殖负调控、蛋白质磷酸化负调控、信号转导负调控、胰岛素样生长因子受体信号通路调控等生物学功能。结论人源性IGFBP3是肿瘤发生的负性调控因子,可介导MMP2及其下游信号通路,参与调控肿瘤的发生、发展。

关键词:胰岛素样生长因子结合蛋白3生物信息学分子结构生物学功能基质金属蛋白酶2

单位:潍坊医学院; 山东潍坊261053; 山东大学附属济南市中心医院

注:因版权方要求,不能公开全文,如需全文,请咨询杂志社

山东医药

统计源期刊

¥580.80

关注 42人评论|9人关注