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基于生物分子网络探讨胃复春片治疗慢性萎缩性胃炎的作用机制研究

李萍; 李园; 李可歆; 张琦; 王艳; 高颖; 苏泽琦; 丁霞 世界中西医结合 2020年第01期

摘要:目的通过生物分子网络分析方法挖掘胃复春片治疗慢性萎缩性胃炎(CAG)的潜在作用靶点和信号通路,从生物信息学角度阐释其潜在作用机制。方法综合利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、台湾中医药数据库(TCM Database@Taiwan)、Pubchem、中药分子机制的生物分析工具(BATMAN-TCM)、人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、DisgeNet数据库和人体表型本体数据库(HPO)分别获得胃复春片的有效成分和相关靶点以及CAG的相关靶点;基于String数据库中已知的蛋白相互作用关系(PPI)构建胃复春片治疗CAG靶点的PPI网络并发现核心靶点;通过DAVID实现京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路和基因本体论(GO)功能富集分析。结果检索获得胃复春片成分相关靶点846个,CAG相关靶点209个;“胃复春片-CAG”PPI网络有32个节点,176条边构成;GO功能和KEGG信号通路的富集分析发现胃复春片治疗CAG的作用机制可能与调控肿瘤相关信号通路如PI3K-Akt信号通路、Jak-STAT信号通路,以及炎症性肠病(IBD)信号通路和TNF信号通路有关,并参与急性炎症应答、细胞因子调节、细胞凋亡等GO功能,尤其对肿瘤相关因子(AKT1、TP53、PTGS2)以及炎症反应相关因子(IL-6、IL1B、TNF)具有重要调节作用。结论胃复春片可能通过调节肿瘤抑制基因和炎症因子等发挥治疗CAG和控制慢性胃炎恶性转化的作用。本研究一方面为明确胃复春片的药理、药效机制提供了有益探索,另一方面也为阐释中药复方的作用机制研究提供了思路和方法学借鉴。

关键词:慢性萎缩性胃炎胃复春片生物网络靶点

单位:北京中医药大学东直门医院; 北京100700; 北京中医药大学中医学院; 北京100029; 北京中医药大学北京中医药研究院; 北京100029

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