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基因宏阵列和荧光定量PCR方法对西瓜枯萎病害土壤中尖孢镰刀菌的快速检测和定量

赵爽 罗佳 凌宁 徐大兵 朗娇娇 胡江 沈其荣 土壤学报 2010年第04期

摘要:采用基因宏阵列(Macroarray)和荧光定量PCR(Real—timePCR)的方法,对引起西瓜枯萎病害的病原菌尖孢镰刀菌(Fusariumoxysporum)进行了快速监测和快速绝对定量,并且对实验条件进行了优化和摸索。结果显示,在西瓜枯萎病害发病较为严重的处理N-+P-和N+P+的根际土壤中,Macroarray检测到强烈的阳性信号,表明尖孢镰刀菌的大量存在,同时荧光定量PCR的结果也表明在这两个处理的根际土壤中尖孢镰刀菌数量最多,分别为每g土壤8.89×10^5和2.24×10^5个拷贝数;而在未发生枯萎病害的处理N’+P-和N++P+中,Macroarray未检测到阳性信号,根际土壤中尖孢镰刀菌数量分别为每g土壤6.23×10^5和3.28×10^5个拷贝数;而四个处理的土体土壤中尖孢镰刀菌的数量均维持在每g土壤10^2~10^3个拷贝数,Macroarray未检测到阳性信号。与传统检测方法如病原菌的分离培养、平板稀释计数等相比,上述分子生物学方法对病原真菌的检测和定量更为准确快速、省时省力。

关键词:尖孢镰刀菌基因宏阵列实时荧光定量pcrsybrgreen

单位:南京农业大学资源与环境科学学院 南京210095 苏省固体有机废弃物资源化高技术研究重点实验室 江苏宜兴214200

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