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水稻与白叶枯病菌互作的基因表达谱分析与差异性表达基因的识别

吴茂森; 田峰; 齐放军; 何晨阳 中国农业科学 2007年第02期

摘要:[目的]从基因组水平上阐明水稻在与白叶枯病菌(Xanthomonas oryzae pv. oryzae,Xoo)感病互作条件下基因表达反应的特征.[方法]用cDNA-AFLP方法对Xoo接种处理不同时间的水稻细胞进行基因表达谱分析.[结果]在测定的大约4 000个水稻cDN段中,363个(9.1%)是差异性表达的,其中295个受Xoo诱导上调表达,68个被抑制下调表达.根据在不同互作时间点的表达特征,它们可分为7种表达类型.对31个差异片段的序列同源性进行分析,发现它们在己公布的水稻全基因组中完全相同的序列,但只有10个基因具有已知或推断的生物学功能,其余21个基因功能未知.用荧光实时定量PCR分析法证实了cDNA-AFLP基因表达结果.[结论]构建了水稻-Xoo感病组合在细胞水平上互作的基因表达谱,从基因组水平上识别了一批受Xoo诱导或抑制表达、与水稻感病反应相关的基因,这些新基因的发现为开展水稻感病功能基因组学的研究提供了材料.

关键词:水稻白叶枯病菌表达谱差异性表达基因

单位:中国农业科学院植物保护研究所/植物病虫害生物学国家重点实验室; 北京100094

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