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奶牛瘤胃微生物元基因组文库中二肽基肽酶Ⅳ的筛选与分析

赵静雯 王加启 赵圣国 孙鹏 卜登攀 胡小丽 卢玉飞 王丹丹 金迪 中国农业科学 2013年第08期

摘要:[目的]研究奶牛瘤胃内参与蛋白质降解过程中二肽基肽酶IV(dipeptidylpeptidaseSIV,DPP—IV)的序列特征和酶学性质。[方法]从奶牛瘤胃微生物Fosmid文库中挑选17664个克隆,利用dpp-IV简并引物筛选含dpp-Ⅳ的阳性克隆。提取阳性克隆的质粒,用限制性内切酶Hind Ⅲ进行酶切。PCR扩增含dpp-IV目的片段,并克隆测序。对阳性克隆的Fosmid末端进行测序。提取阳性克隆粗酶液,利用底物Gly-Pro-pNh检测肽酶活性。[结果]筛选后获得10个含有dpp-IV的阳性克隆(命名为DPI-DPI0)。Fosmid末端序列经BLASTX比对后发现78%的序列可以与数据库的已知序列相匹配,但相似度变化较大(44%-94%)。DPP—IV序列经BioEdit比对后,发现均含有N端保守区域(DWVYEEE)和C端催化区域(GWSYGG),经BLASTP比对发现阳性克隆的DPP—IV分别与Cyclobacteriummarin0/11(43%)、Capnocytophagasp.(63%)、Prevotellaruminicola23(66%)和Solitaleacanadensis(50%)的DPP—IV相似度高。酶活力检测发现DP7肽酶活力最高,为6.88u·mg-1。[结论]从瘤胃微生物Fosmid文库中获得了10个含有dpp-IV的阳性克隆,它们具有不同的dpp-IV序列特征和肽酶活性。

关键词:瘤胃微生物fosmid文库末端序列酶活性

单位:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所/动物营养学国家重点实验室 100193 内蒙古民族大学动物科技学院 内蒙古通辽028000

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