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牛SREBP1基因shRNA序列的筛选及其腺病毒载体的构建与鉴定

付常振 昝林森 王虹 成功 王洪宝 李耀坤 姜碧杰 高建斌 杨宁 中国农业科学 2013年第23期

摘要:【目的】筛选可靶向干扰牛的SREBP1基因的有效shRNA,构建相应腺病毒载体并包装重组腺病毒,为在细胞水平上研究SREBP1基因的功能和作用机制提供基础。【方法】以秦川牛SREBP1基因为研究对象,首先靶向其编码区(codingsequence,CDS)序列设计并合成6条干扰和1条阴性对照shRNA,并构建表达载体pENTR—u6-shRNA。然后与载体psiCHECK-II—SREBP1共转染293A细胞,筛选有效的pENTR—u6-shRNA。其次将筛选的pENTR-u6-shRNA和阴性对照pENTR-U6-NC分别与腺病毒骨架载体pAd/PL-DEST体外重组,得到腺病毒重组载体,并在293A细胞包装扩繁得到高滴度腺病毒,GFP标记法测定病毒滴度。最后将病毒侵染牛前体脂肪细胞,实时荧光定量法(qRT—PCR)检测干扰效率。【结果】筛选出靶向牛SREBP1基因干扰效率为87.4%的shRNA-1053。构建了pad~1053和阴性对照pAd—NC重组腺病毒载体并包装得到Ad-1053和Ad—Nc高滴度病毒,测定得到的病毒滴度分别为7×108。GFU.mL^-1和9×10^8GFU·mL^-1。Ad-1053和hd-NC分别侵染牛前体脂肪细胞,qRT—PCR检测结果显示Ad-1053可显著降低SREBP1基因的mRNA水平(干扰率〉85%),而Ad-NC对SREBP1基因表达无明显影响。【结论】成功筛选得到靶向干扰牛SREBP1基因的有效shRNA,并包装扩繁获得相应的高滴度重组病毒。

关键词:srebp1shrna重组腺病毒

单位:西北农林科技大学动物科技学院 陕西杨凌712100 国家肉牛改良中心 陕西杨凌712100

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