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水稻与稻瘟病菌不同小种互作的基因差异表达谱分析

姜兆远 任金平 刘晓梅 邹晓威 郭晓莉 王继春 温嘉伟 刘文平 夏海丰 洪德志 中国农业科学 2013年第24期

摘要:【目的】分析水稻接种稻瘟病菌(Magnaporthegrisea)48h后亲和互作与非亲和互作反应的基因表达谱,探索水稻对不同稻瘟病菌抗性差异的分子机理。【方法】运用AffymetriX表达谱芯片分析差异表达mRNA;通过分子注释系统平台(MAS3.0)对差异表达基因进行了基因注释及GO分析;应用实时定量PCR对部分差异表达基因进行验证。【结果】在49824个转录本中共检测到大约24000个转录本,F01dchange大于2.5的基因共1028个,其中非亲和互作上调基因460个,下调基因568个。所验证的4个基因的荧光定量PCR结果与芯片结果基本一致。经GO分析差异基因对应蛋白的功能主要涉及信号转导、酶的调节、转录及分子转运等。【结论】水稻与稻瘟病菌非亲和与亲和互作的基因表达谱存在较大差异,基因芯片筛选到的差异表达基因通过G0注释明确了差异基因的分子功能及信号通路,有利于进一步了解植物抗病机制,并可能为稻瘟病防治措施提供新的途径。

关键词:稻瘟病基因表达谱基因芯片

单位:吉林省农业科学院中国农业科技东北创新中心 长春130033 吉林省农业科学院植物保护研究所 吉林公主岭136100 农业部东北作物有害生物综合治理重点实验室 吉林公主岭136100 吉林省通化市农业科学院 吉林通化135007 吉林省农业技术推广总站 长春130021

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