摘要：【目的】细菌区系在梅花鹿（Cervus nippon）瘤胃发酵中发挥着重要作用，然而有关梅花鹿瘤胃细菌区系的研究鲜有报道。研究梅花鹿瘤胃细菌区系，为梅花鹿瘤胃发酵调控提供分子生物学依据。[方法]选取4头2岁龄的装有永久性瘤胃瘘管的成年雄性梅花鹿为研究对象，分别饲喂以柞树叶（0L组，梅花鹿A和B）和玉米秸秆（cs组，梅花鹿C和D）为主要粗饲料的日粮，持续饲喂30d。通过瘤胃瘘管取瘤胃内固液混合物，提取瘤胃微生物基因组DNA。扩增瘤胃细菌16SrRNA基因V3区以及16SrRNA基因，分别用于DGGE和T-RFLP分析。DGGE图谱进行聚类分析，并切取优势条带进行克隆测序，鉴定瘤胃内细菌组成。根据T-RFLP图谱结果计算细菌群落的多样性、优势度、均匀度和丰富度，通过Microbial Community AnalysiSIll（MiCAIII）数据库推测T-RFs可能代表的微生物种类，并进行T-RFLP图谱的聚类分析。【结果】DGGE图谱聚类表明，cs组和0L组瘤胃细菌区系相似性度于65%，表明粗饲料种类影响梅花鹿瘤胃细菌区系。0L组梅花鹿A和B的DGGE图谱相似度大于70％，CS组梅花鹿c和D的DGGE图谱相似性大于75％，而且同组不同个体之间瘤胃细菌区系存在差异。OL组和cs组分别获得20和24个DGGE特异性条带。序列分析表明，cs组条带可归类为拟杆菌门、厚壁菌门和变形菌门，而OL组条带可归类为拟杆菌门、厚壁菌门、变形菌门和互养菌门。OL组与cs组中存在大量Prevotellaspp．，但不同组中Prevotellaspp．在种水平组成不同，主要纤维降解菌为Olostridiumspp．与Eubacteriumspp．T-RFLP结果显示，梅花鹿D（cs组）具有最高的丰富度、多样性、均匀度和最低的优势度，梅花鹿A和B的各项指数相近但低于梅花鹿D，说明OL组中的粗饲料（柞树叶）影响瘤胃中微生物的相对生物量。梅花鹿C和D的各项指数相差较大而且梅花鹿c的指数�

关键词：梅花鹿 细菌区系 普雷沃氏菌 单宁 

单位：中国农业科学院特产研究所吉林省特种经济动物分子重点实验室 长春130112 农业部环境保护科研监测所生态农业研究室 天津300191