摘要：分子标记、基因工程（转基因技术）和基因组学的研究成果为实现对基因型的直接选择和农作物新品种设计育种提供了可能。设计育种旨在控制所有重要农艺性状基因的所有等位性变异。通过精细遗传定位、高饱和染色体片段系的构建和表型鉴定，可以实现设计育种。鉴于一系列可以得到的标记技术、软件工具以及已定位和克隆的水稻基因、已建立的基因-表型（G-P）数据关联信息，设计育种目标已成为现实。主要介绍了设计育种、分子育种及一些基本技术，当前重点应用的基因功能研究与水稻功能基因分子利用的研究进展，并对水稻基因设计育种的前景进行了展望。

关键词：水稻 育种 功能基因组学 基因设计育种 分子标记辅助选择 

单位：中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室 浙江杭州310006