摘要：用262个 SSR 标记对来自不同生态区的540份水稻品种的基因组变异进行扫描,分析该自然群体的遗传多样性、群体结构和连锁不平衡位点,并采用 TASSEL 软件的一般线性模型（GLM）方法进行标记与性状的关联分析.结果表明：1）该自然群体由7个亚群体组成；每个亚群内,无论是共线 SSR 标记位点之间还是非共线 SSR 标记位点之间均存在一定程度的连锁不平衡.2）三年均检测到的与粒长显著相关的标记位点有45个,贡献率最高的是 RM5849（52．86％）,M3766-140是增加表型效应最大的等位变异,载体品种是农香25.与粒宽显著相关的位点有7个,贡献率最高的是 RM17（63．61％）,增加表型效应最大的等位变异是 RM17-145和 RM573-235,载体品种分别是宁粳恢338和早十日黄稻.与粒厚显著相关的位点有11个,贡献率最高的是 RM276（25．44％）,增加表型效应最大的等位变异是 RM508-215和 RM7288-205,载体品种都是红芒沙粳.与千粒重显著相关的位点有6个,贡献率最高的是 RM17（32．17％）,增加表型效应最大的等位变异是 RM17-145,载体品种是宁粳恢338.预测了利用这些载体材料改良籽粒性状的潜在杂交亲本组合.

关键词：水稻 籽粒性状 ssr 分子标记 关联分析 

单位：南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室 江苏南京210095 越南顺华大学顺华农林业大学农学院 越南顺华 江苏省泰州市红旗种业有限公司 江苏泰州225311