摘要：【目的】叶色突变相关基因鉴定和克隆有助于研究光合作用，补充并完善叶绿体发育机理和色素合成代谢途径，为开展水稻的高光效育种提供理论依据。【方法】从粳稻品种Dongjin的组培后代中分离出一个白条纹突变体st13，成熟期测定野生型和st13的主要农艺性状，苗期测定色素含量并观察叶绿体的超微结构；将st13和Dongjin进行正反交，观察F1植株表型，并对F2表型分离进行卡方检验，对st13进行遗传分析；利用st13×南京11（籼稻品种）的F2和F2:3群体，对st13突变基因定位；采用qPCR分析叶绿体发育和叶绿素合成相关基因在st13与野生型相对表达量。【结果】与野生型Dongjin相比，该突变体的株高、单株有效穗数、穗长、结实率和千粒重等主要农艺性状显著下降。苗期的色素含量降低，分蘖期无差异。突变体的叶绿体中既有含丰富的类囊体膜结构的正常叶绿体，也存在无类囊体结构的叶绿体。遗传分析和基因定位结果表明，st13的突变表型受1对隐性核基因控制，突变基因位于第3条染色体长臂InDel（Insertion-Deletion）标记I3-21和I3-22之间。进一步在这两个标记之间设计了6对InDel标记，最终将基因定位在94kb区间内，此区间共有8个候选基因。【结论】这8个候选基因中，有5个假定的蛋白，其他三个都是有功能注释的蛋白，而这三个蛋白在水稻中均未见报道，因此，st13突变是由一个新的叶色基因突变引起的；同时st13中叶绿体发育、叶绿素合成和光合系统相关基因的表达也发生了显著改变，推测ST13可能是调控叶绿体发育的关键基因。

关键词：水稻 白条纹突变体 叶绿体 精细定位 

单位：南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室/农业部长江中下游粳稻生物学与遗传育种重点实验室/长江流域杂交水稻协同创新中心/江苏省现代作物生产中心; 南京210095; 中国农业科学院作物科学研究所; 北京100081; 江苏丘陵地区镇江农业科学研究所; 江苏句容212400