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结核病患者免疫相关基因表达变化的基因芯片研究

赵雁林; 端木宏谨; 李亮; 宋长兴; 赵冰 中华结核和呼吸 2005年第05期

摘要:目的探讨免疫相关基因在结核病患者体内的差异表达.方法应用基因芯片技术和生物信息学方法,对63例单纯结核性胸膜炎患者胸腔积液及其外周血中单核细胞与69例肺癌患者的癌性胸腔积液和其外周血中单核细胞的mRNA表达水平进行分析比较,所做的表达谱杂交检测均重复1次并在荧光交换后再重复1次以抑制噪声,对阳性和部分阴性结果进行northern blotting复验.结果在对基因表达谱原始数据进行标准化校正、聚类分析和统计学处理后,发现在626条免疫相关基因中差异表达基因53条,其中与细胞增殖相关的基因16个,与细胞免疫应答相关的基因14个,与信号传导有关的基因20个,其他相关基因3个;在结核病患者胸腔积液淋巴细胞中tnf-Α、iglλ、il-17、il-17r、hla-dp、lcp1、tcrΑ、tcrΒ、hsp75、cxcr4、fyb、hla-g、hla-a、il18bp、il-2r、lt-Β、il-8、ip-10、mcp-1、il-12、 il-12r、il-10、canx、irf2、 ifn-Γ、tlr、il-1、 il-7、tlr、lsp-1、il-14共31个基因表达较对照组增高4倍以上,il-4、il-18、il-15、ifg-1、scya14、ablim、peci、ppid、hsf2、actg2、 maoa、 ttid、gatm、tgfb3、insr、thbd、trap1、 tcrΓ、tcrΔ、il-13r、il-11、igf1、a2m共22个基因表达水平较对照组降低4倍以上.结论机体抗结核免疫的发生、发展涉及多基因改变,tnf-Α、il-17、il-12 、tcrΑ、tcrΒ、hsp75、cxcr4以及 il-4、il-18、il-15等免疫相关基因差异变化显著,提示其或许可以为结核病临床生物治疗、辅助诊断和患者免疫水平评价提供参考.

关键词:结核病患者基因表达变化应用基因芯片技术northernblotting

单位:101149; 北京市结核病胸部肿瘤研究所-国家结核病参比实验室

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