摘要:目的预测结核分枝杆菌Rv1419蛋白的抗原表位。方法利用DNAStar软件包中Protean软件对Rvl419氨基酸序列进行分析,采用包括二级结构、亲水性、抗原性、可及性、柔韧性、电荷分布等多参数预测其二级结构及T细胞和B细胞抗原表位。结果Rvl419蛋白具有丰富的二级结构和多处抗原指数较高的区段,含有少数潜在的B细胞抗原肽表位(可能在67-70、72-82、142-154、131-137位氨基酸残基或其附近),这些表位抗原性较好,都含有B转角和无规则卷曲结构,呈现在表面的可能性和柔韧性都较大。该蛋白含有较多潜在的T细胞抗原肽表位(可能在5-15、18-22、29-32、43-55、58-62、64--68、86-97、99-109、110-114、117-123、126-128、136-140位氨基酸残基或其附近)。结论结核分枝杆菌Rv1419蛋白是一个T细胞抗原表位占优势的蛋白抗原,也存在B细胞抗原表位,本研究结果为该蛋白抗原表位的进一步研究、应用奠定了基础。
关键词:表位 细菌蛋白质类 蛋白质结构 二级 结核分枝杆菌
单位:军事医学科学院附属医院输血科 北京100071 解放军第三0九医院全军结核病研究所全军结核病防治重点实验室
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