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基于微阵列表达数据的可调FPR差异表达基因筛选

张彦琦; 袁源; 赵增炜; 易东 重庆医学 2007年第04期

摘要:目的基于微阵列表达数据,探索筛选差异表达基因的有效方法。方法在传统t检验和方差分析的基础上,通过对重复实验数据的随机组合,构建秩统计量和期望秩统计量,通过调节二者的差值作为阈值,计算对应假阳性率(FPR),筛选差异表达基因。结果将本方法应用于模拟数据集和真实微阵列表达数据上,均取得较好的效果。结论本方法适用于微阵列表达数据,进行差异表达基因的筛选,并且比传统的方法更具灵活性。

关键词:微阵列差异表达基因假阳性率

单位:第三军医大学军事预防医学院卫生统计学教研室; 重庆400038; 成都蓉生药业有限责任公司; 610000

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