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食管癌血清差异蛋白质组测定结果分析

谭小林 任兴军 王开正 杨成虎 冯峰 胡琼英 丁银环 戴天阳 重庆医学 2011年第07期

摘要:目的用表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)寻找食管癌(EC)患者血清中差异蛋白质组,并建立诊断模型,为其广泛用于临床诊断积累数据资料。方法用SELDI芯片检测食管癌及其相关人群的血清,Biomarker Wiz-ard Software软件筛选出差异蛋白,选择具有显著差异的蛋白质组建立人工神经网络诊断模型,经盲法验证后使用SPSS软件分析各个差异蛋白以及联合人工神经网络技术后的诊断效率,并鉴定相关蛋白。结果筛选出显著差异(P〈0.01)的蛋白质组如下:在食管癌患者血清中表达增高蛋白组[(5 017.6±4.89)、(7 458.5±6.49)、(7 908.1±7.80)、(8 111±8.45)、(8 577±7.80)kD],表达降低蛋白组[(7 748.3±9.10)、(5 890.9±7.32)、(4 213.8±5.93)kD]。差异蛋白质组建立食管癌人工神经网络筛查模型和诊断模型,其灵敏度和特异性超过90%,盲法验证的效果好;人工神经网络预测输出值构成的ROC曲线下面积分别为81.6%和82.1%,经查阅数据库鉴定发现两种蛋白质。结论血清蛋白质谱指纹图结合人工神经网络技术进行蛋白质组学数据挖掘所建模型诊断价值较大,与临床诊断符合程度良好。

关键词:食管肿瘤质谱分析法蛋白质组学神经网络计算机诊断模型

单位:泸州医学院附属医院检验科 四川泸州646000 四川省射洪县人民医院629200

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