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乳腺癌高表达基因FAM83A的生物信息学分析

刘镭 黄亮 车清海 赵恩宏 黄旭 程露阳 肖丽君 重庆医学 2013年第03期

摘要:目的筛选乳腺癌高表达基因,用生物信息学方法预测FAM83A生物学功能。方法使用肿瘤基因组解剖计划数据库的数字基因表达演示工具,在乳腺癌组织和乳腺良性肿瘤组织中筛选差异表达的基因。生物信息学方法预测FAM83A基因及其编码蛋白的序列同源性、理化性质、亚细胞定位、结构和表达谱。RT-PCR方法测定FAM83A在乳腺癌、乳腺纤维瘤和正常乳腺组织中的表达。结果筛选出差异表达基因FAM83A。发现其有3个不同的剪接体,基因进化保守,亚细胞定位于线粒体的可能性大。预测有PK,PKA等磷酸化位点,MAPK作用识别位点,SH2、SH3,RPEL和WH2结合基序。二级结构主要是α螺旋和无规则卷曲。RT-PCR证实FAM83A在乳腺癌组织中高表达,而在乳腺良性肿瘤和正常乳腺组织中均无表达。结论 FAM83A是一个乳腺癌高表达基因,可能作为乳腺癌分子机制研究的靶点。

关键词:乳腺肿瘤生物信息学sage库fam83a

单位:承德医学院基础医学部免疫教研室 河北承德067000 承德医学院附属医院肿瘤诊治中心 河北承德067000 吉林市龙潭区妇幼保健院妇产科 132000

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