摘要：粳稻品系Y98149是从离子束诱变的后代中获得的显性半矮秆突变体，与野生型Y98148是1对株高近等基因系。将已经获得的3个与水稻显性半矮秆基因紧密连锁的RAPD标记分别克隆、测序，根据测序结果设计了3对特异性PCR引物，成功地将RAPD标记S1041525、S1076549和S1272403转化成更稳定的SCAR标记SCS1041498、SCS1076510和SCS1272388。通过Y98148×Y98149的F2代分离群体的分析，这3个SCAR标记与显性半矮秆基因的遗传距离分别为12．6cM、7．5cM和16．3cM，且位于基因的同一侧。序列同源性比较表明，标记S1272403为单拷贝，其核苷酸序列与水稻第7染色体上2个BAC克隆B1249D05（AP006451）和OJ1212-C12（AP005604）同源性为99％，B1249D05与OJ1212-C12有23kb的重叠区域，标记S1272403，位于这个重叠区域，据此初步将显性半矮秆基因定位，为进一步精确定位和图位克隆奠定了基础。

关键词：水稻 半矮秆突变体 显性基因 scar 基因定位 

单位：中国科学院安徽省离子束生物工程学重点实验室; 安徽合肥230031; 安徽省农业科学院水稻研究所; 安徽合肥230031; 上海市农业科学院作物所; 上海201106