摘要：广亲和基因S5-n是能够恢复籼、粳杂种育性的基因，利用常规育种方法回交转育广亲和基因需要通过配组杂种F1，根据F1的育性判断和选择S5-n，选育周期长，方法繁琐。因此，在广亲和遗传改良和聚合育种中需要寻找一种快速、简便的广亲和基因检测方法。本研究根据水稻广亲和基因和籼粳S-5等位基因序列存在136bp缺失的特征，设计了InDel标记S5136。前人研究已经明确02428、Dualr、CPSLO17具有鄹氓分子标记S5136PCR扩增这3个材料的带型为缺失带型，而不携带广亲和基因S5-n的材料的带型为非缺失带型。利用该标记对3037与02428的F2群体分析表明，该标记能准确区分S5-n、S5-i纯合及杂合基因型，标记基因型符合1：2：1比例，没有发生偏分离现象。利用该标记从554份水稻品种资源（D．sativa L．）和27份普通野生稻（D．rufipogen Griff．）以及24份江淮流域杂草稻资源中筛选出具有缺失带型的资源材料13份，并对其PCR产物测序证实为S5-n，对Kasalath的广亲和性进行了初步验证；从20份02428的高世代育种材料中，筛选到携带广亲和基因S5-n的恢复系2份。该标记可以用于S5-n基因资源筛选、分子标记辅助选择育种和培矮64S为母本的杂交种种子纯度鉴定。

关键词：功能标记 亚洲栽培稻 普通野生稻 杂草稻 

单位：江苏省农业科学院粮食作物研究所／江苏省优质水稻工程技术研究中心; 江苏南京210014