摘要：为了开发大豆基因靶向的功能分子标记，本研究采用生物信息学方法分析了大豆基因重测序数据，筛选出酶切位点突变的SNP位点，设计PCR引物163对，选用东北地区主栽品种绥农14的DNA为模板进行PCR扩增，其中139对引物获得大小为400～1200bp的特异片段。以大豆绥农14、合丰25、Acher、Evans、Peking、PI209332、固新野生大豆、科丰1号和南农1138—2的DNA为模板，采用筛选的139对引物进行PCR扩增，对扩增产物进行酶切分析，发现73对引物的PCR产物具有酶切多态性，开发出CAPS标记73个。通过功能注释分析发现，这73个CAPS标记靶向的基因主要参与细胞内亚细胞定位过程、蛋白质的结合与催化以及代谢过程等，与大豆重要农艺性状的形成相关，可以用于大豆品种的鉴定和分子系统进化的研究。

关键词：大豆 重测序数据 单核苷酸多态性 酶切扩增多态性序列 基因靶向功能标记 

单位：东北农业大学生命科学学院; 黑龙江哈尔滨150030