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主要麻类作物的ITS序列分析与系统进化

张力岚; 王俊; 万雪贝; 徐益; 张列梅; 方平平; 祁建民; 张立武 作物学报 2017年第06期

摘要:比较主要麻类作物和测序植物间的ITS序列,可明确它们间系统位置和进化关系。本研究采用PCR扩增和搜索GenBank数据库,获得32份麻类作物和11份测序作物的核糖体内转录间隔区(internal transcribed spacers,ITS)序列,利用MEGE软件分析ITS长度、G+C含量与同源性百分比差异。结果表明,黄麻属、红麻属、苎麻属和亚麻属的ITS基本序列全长分别为963、939、658和686bp;G+C含量分别为57.87%、58.03%、59.05%和53.75%。黄麻属变异区域集中在220~386bp间,红麻属变异区域集中在2个区段(206~347bp,599~713bp),苎麻属ITS变异区域分布在4个区段(158~163bp、193~199bp、288~333bp和681~688bp),亚麻属ITS变异区域分布在5个区段(219~229bp、235~240bp、427~432bp、468~484bp和588~594bp)。系统位置分析表明,红麻属与棉花亲缘关系最近,黄麻与棉花亲缘关系较近;亚麻与苎麻各为一小支。系统位置分析与传统的植物分类结果较一致。研究主要麻类作物比较基因组学时,红麻、黄麻可参考棉花,苎麻可参考杨树或蓖麻。推测红麻属的进化时间约为33.7百万年前(millionyearsago,MYA),黄麻属约为65.3MYA,苎麻属约为67.5MYA,亚麻属约为90.5MYA。主要麻类作物进化时间越久,同属不同种之间ITS变异区段越多。

关键词:麻类作物its系统位置进化关系

单位:福建农林大学作物科学学院/作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室/福建省作物设计育种重点实验室; 福建福州350002; 福建农林大学海峡联合研究院基因组与生物技术中心; 福建福州350002

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