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基于EST-SSR的祁门种群体遗传多样性和亲缘关系分析

李赛君 雷雨 段继华 罗意 黄飞毅 董丽娟 茶叶科学 2015年第04期

摘要:利用24对EST-SSR引物对祁门种群体66个单株和安徽1号进行遗传多样性和亲缘关系分析。结果表明:祁门种群体具有相对较高的遗传多样性,24对引物共检测到等位位点69个,平均2.88个;引物多态性含量PIC为0.18~0.85,平均值为0.47;杂合度观测值(Ho)在0.09~0.96之间,平均值为0.41;杂合度期望值(He)在0.23~0.76之间,平均值为0.50;群体内的Shannon指数I为0.39~1.50,平均0.89。根据相似系数矩阵按UPGMA法进行聚类,在相似系数平均值0.50处可将参试的67份材料划分为六大类,其中第Ⅰ类含有44个祁门种群体单株及安徽1号,占总数的67.16%,是祁门种的核心类群。

关键词:祁门种群体遗传多样性亲缘关系

单位:湖南省茶叶研究所国家茶树改良中心湖南分中心

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