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基于改进马尔可夫模型的启动子预测算法

孔帆帆; 李宏; 李号双; 尹翔 计算机工程与科学 2007年第12期

摘要:本文实现了基于马尔可夫模型的启动子预测算法,结合隐马尔可夫模型中的前向算法,改进了基于马尔可夫理论的启动子预测方法,具体改进了碱基转移概率的算法和序列所在模型的概率。改进的马尔可夫模型的预测结果显示,以此模型建立的系统能更有效地识别数据集中的三种序列。

关键词:启动子识别马尔可夫模型前向算法

单位:中南大学信息科学与工程学院; 湖南长沙410083; 中南大学生物医学工程研究院; 湖南长沙410008

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计算机工程与科学

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