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基因组学与应用生物学
北大期刊

影响因子:1.11

预计审稿周期:1-3个月

基因组学与应用生物学杂志

主管单位:广西大学  主办单位:广西大学
  • 创刊时间:1982
  • 国际刊号:1674-568X
  • 出版周期:月刊
  • 邮政编码:530004
  • 国内刊号:45-1369/Q
  • 邮发代号:48-213
  • 全年订价:¥ 920.00
  • 发行地区:广西
  • 出版语言:中文
主要栏目:
  • 综述与专论
  • 研究论文
  • 研究报告
  • 实验技术。
  • 绵羊BMP-15基因在不同产羔性状母羊中的表达量差异及分析

    选择分别影响Hanna、Cambridge与Belclare三个不同品种绵羊高繁殖力的骨形态发生蛋白15(bone morphogenetic protein 15,BMP-15)为候选基因,为了解不同产羔性能母羊BMP-15基因在不同组织中的表达差异,及其与产羔数性状关联性分析,采用real time RT-PCR的方法检测BMP-15基因在蒙古羊、无角陶赛特羊、小尾寒羊3种绵羊母羊的下丘脑、垂体、卵巢、...

  • 青海湖裸鲤CYP17a2基因的克隆及表达分析

    CYP17a2基因是细胞色素CYP17(cytochrome P450,CYP)超家族成员之一,在卵巢发育过程中,可以与CYP17a1共同作用控制卵子的发育和成熟。研究和掌握青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalskii)卵巢发育的基本规律,可为该鱼种的人工增殖放流及其资源保护和恢复提供技术支撑。本研究采用普通PCR和RACE方法克隆得到了青海湖裸鲤CYP17a2基因全长c DNA序列,...

  • 草鱼ROCK1基因全长克隆、生物信息学分析及组织差异表达

    ROCK1是ROCK(即Rho激酶)家族的成员之一,ROCK家族是小G蛋白Rho的下游效应因子,被Rho蛋白激活后ROCK1作用于下游效应分子,对其介导的信号通路进行调节,参与细胞增殖、迁移、形态改变等。ROCK1与组织纤维化、癌症、心血管等疾病的发生密切相关。本实验采用c DNA末端快速扩增法克隆草鱼ROCK1基因全长序列,预测并分析其编码的蛋白,采用实时荧光定...

  • 凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)Wnt9α基因的克隆与表达分析

    Wnt信号通路已被证实在细胞增殖分化、胚胎发育等多方面起重要作用,Wnt基因家族是重要的调节因子。为了了解更多的无脊椎动物Wnt基因相关的信息,本研究首次克隆并鉴定了凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)中的Wnt9α基因,命名为Lv Wnt9α,其基因全长c DNA为1 845 bp,包含长度为1 383 bp的开放阅读框(open reading frame,ORF),编码460个氨基酸,...

  • 瘤背石磺Os-NMHC的克隆、表达分析以及NMHC进化节点探讨

    本研究以石磺科贝类转录组数据库为基础,克隆出一条Ⅱ型非肌肉型肌球蛋白重链(NMHCⅡ)基因的全长c DNA,将其命名为Os-NMHC。该序列全长为6 057 bp,包括5 733 bp的开放阅读框,236 bp的5'端非翻译区,88 bp的3'端非翻译区,共编码1 910个氨基酸。预测蛋白质等电点为5.26,相对分子质量为220.46 k D。通过Phyre2程序和Pymol软件构建蛋白质三级结构...

  • 锤胁跷蝽YsigOrco基因的克隆、鉴定与表达

    昆虫对气味的识别需要专门的嗅觉受体ORs,而嗅觉受体需要与一个保守的非典型嗅觉受体Orco结合成异源杂合体才能起嗅觉作用。有关Orco的同源基因在其它种昆虫中已经被鉴定出来。本研究通过对前期锤胁跷蝽触角转录组数据分析和RT-PCR,也鉴定出了一个Orco基因,并通过q RT-PCR对该基因的组织表达谱进行分析。结果表明,锤胁跷蝽Orco基因ORF全长1 425 ...

  • 封面图片介绍

    动脉粥样硬化(atherosclerosis,AS)是心血管系统最常见的一种疾病,是以体内动脉壁增厚、变硬和弹性减弱为主要特征的动脉硬化性疾病。该病常发生在脑动脉、额主动脉、冠状动脉、股动脉等处,可能会引起一系列的并发症和继发症,是多因素多途径相互作用的结果。

  • 德国小蠊Akirin基因的克隆及表达分析

    Akirin基因是新近发现的在果蝇NF-κB依赖的Imd信号通路调控中不可或缺的转录因子。在除果蝇以外的昆虫中,Akirin基因是否参与Imd通路的调控,亦或对NF-κB依赖的Toll通路也有调控作用还未有报道。本研究旨在初步研究德国小蠊Blattella germanica中Akirin基因的基本特征、在不同组织中的表达模式及注射法RNAi实验对Akirin基因沉默效果,以期为Akirin...

  • 关岭牛PPARγ基因原核表达载体的构建及生物信息学分析

    本研究旨在通过克隆关岭牛PPARγ基因CDS区及构建p ET32a(+)-PPARγ真核表达载体。本研究通过RT-PCR技术克隆关岭牛PPARγ基因的CDS区,采用DNAStar和Ex PASy等软件对该基因CDS区进行序列分析;利用双酶切的方法构建原核表达载体p ET32a(+)-PPARγ,结果显示,关岭牛PPARγ基因的CDS区全长1 428 bp,编码475个氨基酸。本研究成功克隆了关岭牛PPARγ基...

  • 柴达木黄牛Y-SNPs遗传多样性、群体遗传结构及父系起源

    为从分子水平上探究柴达木黄牛的父系遗传多样性、群体遗传结构及起源,本研究利用PCR产物直接测序和生物信息学方法对62头柴达木黄牛公牛2个Y染色体标记(即UTY-19和ZFY-10)进行多态性检测分析,结果表明:柴达木黄牛在2个Y染色体标记上均具有多态性,其中UTY-19标记检测到1个C〉A核苷酸颠换,而ZFY-10标记未发现SNP位点,但发现存在1个GT核苷酸插...

  • 马氏珠母贝(Pinctada fucata martensii)近交家系与其杂交子代DNA甲基化差异分析

    2012年4月,利用马氏珠母贝全同胞家系进行家系内与家系间交配组合构建了近交家系(A与D)与杂交家系(B与C)。贝龄2龄时,比较家系生长性状差异,利用甲基化敏感多态性扩增技术(MSAP)检测了4个家系甲基化水平的差异,估计了甲基化比例与生长性状平均值相关性系数。结果表明,家系杂交子代的平均壳长、平均壳高、平均壳宽与平均体重均值大于近交家...

  • 猪蛔虫全基因组微卫星分布规律

    为了探究猪蛔虫全基因组微卫星分布规律,本研究以已公布的猪蛔虫全基因组为基础,通过生物信息学方法,应用MSDB(microsatellite search and building database)从中搜索微卫星序列,并进行统计分析。针对微卫星序列设计40对引物,并通过e-PCR进行验证。得到结论,猪蛔虫基因组中存在682个微卫星位点,总长度为23 572 bp,占全基因组的8.67%。重复类...

  • 鹞落坪国家级自然保护区蝶类的物种多样性及区系组成

    为研究鹞落坪自然保护区蝴蝶物种多样性和区系组成,于2004~2016年间对保护区开展蝶类系统调查。研究表明:鹞落坪国家级自然保护区共有蝶类124种,隶属于9科79属;单种属56个,占70.89%。在世界动物地理区系中,以东洋-古北种成分占优势,兼有一定数量的东洋种和少量的古北种。在中国动物地理区系中,以华中区为主,占100%;华北区和华南区次之,分别占7...

  • Legume Genomics and Genetics(LGG)

  • 哈氏弧菌(Vibrio harveyi)recA基因的克隆与原核表达

    SOS反应不仅能够促使细菌本身产生耐药性,而且与细菌耐药基因的水平转移密切相关。rec A是细菌SOS反应的重要基因,影响SOS反应的开启和关闭。本研究以水产养殖经济动物的条件致病菌哈氏弧菌ZJ0603基因组DNA为模板,设计同源引物克隆出SOS基因rec A(recombinase A),并对rec A基因进行了生物信息学分析。并构建了rec A基因的原核表达载体PGEX-rec...

  • International Journal of Super Species Research

  • 广西百色喀斯特地貌土壤产铁载体细菌的分离和鉴定

    由于碳酸盐性质和特点,导致喀斯特地区的土壤有丰富的矿质元素,尤其是其中的铁氧化物,并具有丰富的有益微生物种群。针对具有潜在植物促生作用的铁载体产生菌,本研究从广西百色地区选取典型喀斯特地貌区域进行土壤采样,然后进行土壤理化性质测定与菌株分离,筛选铁载体产生菌。最终从66份土壤样品中得到140株菌株。16S r DNA测序分析鉴定出22属66...

  • 转基因银中杨对根际土壤微生物的影响

    本研究应用土壤稀释涂布平板法对转基因银中杨(S13系列)根际土壤五大微生物数量进行了测定,并进一步分析了土层深度与土壤微生物数量间的关系。研究表明:0~30 cm与30~60 cm土样中,五大根际土壤微生物(细菌,真菌,放线菌,芽孢杆菌,固氮菌)分布比例一致,均为细菌占主体,其次为固氮菌、放线菌、芽孢杆菌,真菌最少;30~60 cm土样中,转基因银中...

  • Journal of Mosquito Research(JMR)

  • DGGE揭示红壤稻田以产甲烷菌为主的稳定古菌群落结构特征

    尽管古菌在农田土壤生态系统物质、能量循环中的作用尚未系统揭示,但已有研究表明产甲烷古菌和氨氧化古菌等在甲烷排放、固氮等方面具有重要生态功能。本研究采用优化的变性梯度凝胶电泳(DGGE)与克隆、序列测定相结合的方法,基于古菌16S V4~V5区分析我国水稻种植最常见的红壤地区稻田古菌在水稻生长不同时期的群落结构及多样性。在采集自江西...

  • 苏云金芽孢杆菌毒蛋白发掘方法的研究进展

    自上世纪初发现苏云金芽孢杆菌对昆虫有杀虫活性以来,如何发掘利用苏云金芽孢杆菌的杀虫晶体蛋白服务于农业生产和人类的卫生防控就成为一个重要课题。从早期的分离菌株使用菌体的复合物喷施到使用分子手段转化植物特定表达,人类在苏云金芽孢杆菌杀虫晶体蛋白的利用精准度上在不断提高,但随之而来就是抗性的产生。因此不断发掘可使用的新的苏云...

  • International Journal of Marine Science(IJMS)

  • 苦荞转录因子基因FtDREB1和FtDREB2的克隆及其对非生物胁迫的应答

    基于苦荞(Fagopyrum tataricum)花期转录组数据,采用RT-PCR技术克隆到2个编码DREB类转录因子的基因,命名为Ft DREB1和Ft DREB2。氨基酸多重序列比对表明,其编码蛋白Ft DREB1和Ft DREB2具有与拟南芥DREB相同的保守AP2结构域。进化树分析表明,Ft DREB1和Ft DREB2与抗逆相关DREB转录因子归为A2亚家族。实时荧光定量PCR分析表明,在PEG模拟的干旱胁...

  • 陆地棉干旱胁迫相关基因GhPR-10的克隆及表达分析

    病程相关蛋白(pathogenesis-related proteins,PR)的产生与积累是植物体应对生物或非生物胁迫的主要特征之一,而病程相关蛋白10(PR-10)是这类蛋白家族中的重要成员。该研究在前期蛋白质组学分析的基础上,采用同源克隆法和RACE技术相结合,设计了一对引物,克隆了陆地棉"KK1543"干旱胁迫下差异表达的Gh PR-10。Gh PR-10基因具有一个432 bp的...

  • 油橄榄HMGR基因家族的克隆表达及功能验证

    3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶(HMGR),催化3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶A(HMG-Co A)生成甲羟戊酸(MVA),是MVA途径中第一个关键酶。油橄榄是一种重要的经济油料作物,其含有的萜类物质具有重要营养价值,但关于调控萜类物质代谢途径的关键基因研究较少。为研究萜类合成途径关键酶基因HMGR,本研究采用RT-PCR法克隆油橄榄HMGR基因,进行生...

  • International Journal of Molecular Veterinary Research(IJMVR)

  • 梭梭NAC转录因子HaNAC38、HaNAC42克隆及表达分析

    本研究从梭梭中克隆得到2个NAC转录因子,分别命名为Ha NAC38和Ha NAC42。Ha NAC38读码框长879 bp,编码292个氨基酸;Ha NAC42读码框长582 bp,编码198个氨基酸。序列比对显示Ha NAC38和Ha NAC42均含有NAC家族的A、B、C、D、E保守结构域。荧光定量PCR分析结果显示,梭梭(Haloxylon ammodendron,H.ammodendron)幼苗中Ha NAC38和Ha NAC42基因在干旱...

  • Molecular Entomology

  • 梭梭14-3-3蛋白基因HaFT-5、HaFT-6克隆及表达分析

    14-3-3蛋白是生物体内重要的调节蛋白,对细胞代谢及循环、信号传导、转录调节、蛋白跨膜转运、以及生物胁迫和非生物胁迫等多种生理过程均有重要的调节作用。本研究用RT-PCR从梭梭中克隆2个14-3-3蛋白基因,分别命名为Ha FT-5、Ha FT-6。用q RT-PCR分析Ha FT-5、Ha FT-6基因在不同处理后的表达。研究显示,Ha FT-5全长501 bp,编码139个氨基酸;Ha F...

  • 泡核桃肌醇半乳糖苷合成酶基因克隆及表达分析

    肌醇半乳糖苷合成酶是植物中棉子糖系列寡糖合成中的关键酶,在植物抗性生理中扮演重要作用。本研究利用RT-PCR技术从泡核桃中成功克隆获得一个受冷害诱导的肌醇半乳糖苷合成酶基因(Js GS1),其含有1 026 bp的开放阅读框,编码341个氨基酸,登录号为:KX657831。该基因推断的蛋白与核桃(Juglans regia)GS蛋白的相似性为89%;系统进化树分析显示其...

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