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基于随机森林的潜在k近邻算法及其在基因表达数据分类中的应用

杨帆 林琛 周绮凤 符长虹 罗林开 系统工程理论与实践 2012年第04期

摘要:随机森林被广泛应用于包括癌症诊断在内的生物信息学领域.从自适应k近邻的角度分析了随机森林的分类机理,分析其存在的信息损失,据此提出一种新的投票机制,称为基于随机森林的潜在k近邻算法RF-PN,能够充分利用决策树上的OOB样本信息,显著改善随机森林的分类性能.6个癌症基因表达数据集上的对比实验表明,RF-PN的分类准确率优于原算法.

关键词:随机森林基因表达数据

单位:厦门大学自动化系 厦门361005 厦门大学计算机科学系 厦门361005

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系统工程理论与实践

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