摘要：【目的】利用小麦EST序列数据库开发EST—SSR标记。【方法】对GenBank／dbEST注册的普通小麦EST序列（2006．4．18—2007．2．4）进行SSR查找，采用Primer5．0软件设计EST—SSR引物，选用3个小麦品种进行有效性检测，利用RIL群体和Mapmaker／Exp3．0软件进行遗传作图。【结果】在265362条普通小麦EST序列中，共发现6314个SSR，占整个EST数据库的2．38％。其中二核苷酸、三核苷酸重复序列最多，分别为2237（35．43％）和2084（33．01％）个。二核苷酸重复中，以GA／CT和AG／TC出现频率最高、分别占SSR总数的17．85％和10．37％，其次是CA／GT（4．07％）和AC／TG（2．53％）；三核苷酸重复中，CAA／GTT（3．93％）、CGG／GCC（3．83％）、CGC／GCG（3．36％）、GGC／CCG（3．14％）、CTT／GAA（2．53％）、TGC／ACG（2．27％）以较高的频率出现。根据筛选得到的微卫星序列共设计了596个EST—SSR引物对，选择其中95分以上的194个合成。PCR检测表明，165个引物对（85％）可以扩增出稳定清晰的带型；在RIL群体中检测到21个EST-SSR引物26个位点有多态性，将其中的23个位点整合到已有的小麦遗传图谱上。【结论】开发了165个小麦EST—SSR新标记，EST序列是小麦SSR标记的重要来源。

关键词：小麦 分子标记 ril 遗传图谱 

单位：山东农业大学农学院/作物生物学国家重点实验室 山东泰安271018