摘要：[目的]利用高密度SNP标记解析骨干亲本京411的遗传结构，并研究其根系性状遗传特征，为培育高产广适性品种奠定基础。[方法]选用京411及其14个衍生品种（系），包括衍生一代6份，衍生二代8份，每品种选取饱满且大小一致的种子在发苗网上生长6 d，每份材料选取大小一致的幼苗转移至培养盘，每个培养盘种植3次重复，连续培养15 d后测定苗期根部性状的最长根长、侧根长、主根长、总根长、侧根表面积、主根表面积、总根表面积、总根尖数和根系干重。利用90K SNP芯片分析京411及其衍生后代群体的遗传结构和遗传区段传递，结合逐步回归分析定位苗期根部性状基因，探讨京411携带的优异根系基因在衍生后代中的分布。[结果]京411衍生群体平均遗传相似性为57.9%，该亲本与其衍生一代和衍生二代相同的等位变异频率分别为63.9%和67.9%，显著高于理论值。在A、B和D基因组间的相同等位变异频率分别为62.2%、61.3%和74.3%。京411的侧根和根尖数均优于其衍生品种，衍生品种的主根长和根干物质重量等性状的改良较为显著。以已有定位信息的SNP标记与根系性状进行逐步回归分析，共发掘出35个根系性状位点，3DL和5BL上携带控制根长性状的主效位点，分别与SNP标记wsnp_Ex_c1032_1972861和BS00100708_51关联，可用于京411衍生群体中分子辅助选择。来自京411的26个位点对根部性状起正向效应，中麦175和CA0958携带正向效应区段最多，占正向效应位点总数的73.1%。[结论]传统育种对地上部农艺性状的选择，可有效促进地下根系的改良，相当于对优异性状遗传片段的聚合。在京411衍生群体中，中麦175是针对骨干亲本遗传改良最成功的品种，不仅携带较多的京411优异根系基因，而且其主要根系性状、产量表现及广适性均优于京411。

关键词：普通小麦 骨干亲本 根部性状 snp标记 新基因位点 

单位：中国农业科学院作物科学研究所、国家小麦改良中心 北京100081 中国科学院遗传与发育生物学研究所、植物细胞与染色体工程国家重点实验室 北京100101 CIMMYT中国办事处 北京100081