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基于优势比的多因子降维法在SNP交互分析中的应用

华琳 郑卫英 刘红 中国优生与遗传 2008年第11期

摘要:在遗传关联研究中,识别SNP交互对研究复杂疾病的易感性有重要作用。多因子降维法(multifactor dimensionality reduction,MDR)可以用来识别多位点基因型与疾病的关系,但容易出现假阳性错误。为此,本文提出基于优势比的多因子降维法(oddsratio—multifactor dimensionality reduction,OR—MDR),将优势比作为量化指标研究SNP交互对疾病带来的风险。结果表明,OR—MDR方法要优于传统的MDR方法,它可以按照优势比对风险SNP交互进行排序,发现与疾病关联最强的SNP交互,这是传统的MDR方法所不能比拟的。

关键词:ormdrsnp关联

单位:首都医科大学生物医学工程学院 北京100069

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中国优生与遗传

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