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焦磷酸测序技术检测HBV基本核心启动子变异的研究

谈国蕾; 吴引伟; 文剑; 赵磊; 宋玉华; 张亮 山东医药 2007年第26期

摘要:目的建立HBV基本核心启动子(BCP)区变异的快速检测方法。方法采用焦磷酸测序(pyrose-quencing)技术,设计一对引物,其中一条经生物素标记,PCR扩增产物含HBVBCPA1762T/G1764A双突变的区域,借用生物素包被葡聚珠纯化单链PCR产物,设计一条测序引物,运用焦磷酸测序技术对A1762T/G1764A两个变异点进行变异分析。通过对已知变异类型的HBV分离株进行测定分析,评价所建立方法的检测敏感性和特异性。结果PCR扩增后,可在2h内得到A1762T/G1764A两个变异点的突变情况。所建立方法的检测灵敏度达到HBV.DNA血清中的含量为10^3copies/ml;在所分析的HBVBCP区均可检测出变异株、非变异株及混合株,且所检测的结果与直接测序方法结果符合率为95%。结论Pyrosequencing技术用于检测病毒基因突变有高通量、自动化程度高和结果准确等特点,适用于对HBVBCP区突变进行快速高通量检测。

关键词:焦磷酸测序肝炎病毒乙型基本核心启动子变异

单位:东南大学医学院附属南京市第二医院; 江苏南京210003

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