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焦磷酸测序法鉴定临床常见病原菌

公衍文 任绪义 胡成进 重庆医学 2010年第22期

摘要:目的建立高效的焦磷酸测序鉴定临床常见病原菌的方法。方法在细菌16S rRNA的V1及V3可变区两端保守序列设计PCR扩增通用引物及焦磷酸测序引物,PCR扩增后焦磷酸测序测定V1及V3可变区序列,测序结果与数据库比对判断细菌种属。结果在4 h内完成96株细菌的鉴定,所有菌株鉴定结果与常规鉴定结果一致。结论焦磷酸测序技术可以用于临床分离菌株的鉴定,且具有费用相对低廉、高通量、鉴定能力强等优点。

关键词:细菌16srrna焦磷酸测序

单位:济南军区总医院实验诊断科 济南250031 杭州迪安医学检验中心 310030

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