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中国水稻条纹病毒两个亚种群代表性分离物全基因组核苷酸序列分析

魏太云; 林含新; 吴祖建; 林奇英; 谢联辉 中国农业科学 2004年第06期

摘要:首次测定了中国水稻条纹病毒(RSV)常年流行区云南楚雄(CX)分离物及病害暴发区江苏洪泽(HZ)分离物全基因组核苷酸序列,其中CX分离物全长为17 093 nts,HZ分离物全长为17 150 nts.与已报道的日本T分离物全长序列(17 145 nts)相比较,CX分离物变异较大.3个分离物基因组结构组成一致,5′端和3′末端非编码区最为保守;7个编码区保守性次之;变异主要发生在IR上.同源性分析表明,HZ分离物与日本T分离物的亲缘关系较中国2个分离物间的亲缘关系更为接近,这表明HZ和CX分离物基本上能够代表病毒自然种群中存在的2个差异较为明显的亚种群.

关键词:中国水稻条纹病毒亚种群基因组序列分析

单位:福建农林大学植物病毒研究所; 福州; 350002

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