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中国荷斯坦牛CXCR1基因编码区SNP多态与临床乳房炎和生产寿命的关联分析

王梦琦; 倪炜; 张慧敏; 杨章平; 王西朴; 蒋彦森; 毛永江 中国农业科学 2017年第12期

摘要:【目的】探讨中国荷斯坦牛CXCR1基因编码区SNP突变与临床乳房炎和生产寿命的相关性。【方法】根据CXCR1基因编码区序列,利用PCR-直接测序法对低SCS和高SCS样本各20个样本进行SNP筛查,最后对所选择的4个SNP位点利用飞行质谱法对866头中国荷斯坦牛进行检测,同时收集所检测牛只临床乳房炎和生产寿命等信息,利用多因素方差分析法、Logistic回归、Cox生存回归等方法分析以上SNP位点突变与临床乳房炎发生次数和生产寿命的相关性。【结果】CXCR1基因编码区共发现13个SNP位点(291 C〉T、333 C〉G、337 A〉G、365 C〉T、570 A〉G、642 A〉G、735 C〉G、816 A〉C、819 A〉G、980 A〉G、995 A〉G、1008 C〉T和1068 A〉G),分为4个连锁群,随后从每个连锁群中各选择1个SNP位点(642 A〉G,816A〉C,980 A〉G和1068 A〉G),利用飞行质谱法对大样本中国荷斯坦牛进行检测。4个SNP位点共有9种单倍型,其中单倍型GAGG频率最高(0.3141),而单倍型ACAA频率最低(0.0017)。CXCR1-642与2胎牛患临床乳房炎次数有显著相关(P〈0.05),AG基因型个体2胎奶牛患临床乳房炎次数显著高于AA基因型(P〈0.05),CXCR1-816 AA基因型个体3胎奶牛患临床乳房炎次数显著低于AC和CC基因型(P〈0.05),其它SNP位点与各胎次临床乳房炎发生次数均无显著相关(P〉0.05)。CXCR1-816与奶牛离群月龄有极显著相关(P〈0.01),与奶牛生产月龄和离群胎次有显著相关(P〈0.05),CXCR1-816 AA基因型个体生产月龄、离群月龄和离群胎次均显著高于CC基因型个体(P〈0.05),而其它SNP位点对生产月龄、离群月龄和离群胎次均无显著相关(P〉0.05)。Cox生存分析表明:只有CXCR1-816位点与奶牛生存时间有显著相关(P〈0.05),CXCR1-816 CC基因型个体在各时间段的生存概率均低于AA和AC基因型个体。【结论】CXCR1-816 A〉C突变与中国荷斯坦牛患临床乳房炎次数和�

关键词:中国荷斯坦牛cxcr1snp临床乳房炎生产寿命

单位:扬州大学动物科学与技术学院; 江苏扬州225009; 江苏君乐宝乳业有限公司; 江苏徐州221721

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