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中国人群中C6orf37第二外显子VNTR多态性的研究

崔晶; 王炜; 王敏; 林洁; 马裕; 阮文静; 徐静; 来茂德 浙江大学学报·医学版 2006年第04期

摘要:目的:证实C6orf37编码区VNTR位点,检测其多态性在中国人群中的分布特点,并寻找VNTR多态性检测的理想方法。方法:用RT—PCR及测序证实C6orf37编码区的VNTR位点,并用SSLP和DHPLC两种方法对166例中国人进行VNTR基因分型。结果:C6orf37基因的第二外显子区存在一个新的VNTR多态性位点,其核心序列为GGCGGCGACTTCGGC,编码5个氨基酸(G—G—D—F—G),重复3到5次。该位点存在3种等位基因:a(3次重复),b(4次重复),c(5次重复),6种基因型:a/a,b/b,c/c,a/b,a/c,b/c。在中国人群中的a、b、c等位基因频率分别为0.145,0.304,0.551。杂和度为0.583,多态信息含量为0.510。DHPLC与SSLP检测VNTR多态性的结果一致,但DHPLC具有快速、经济、高通量的特点。结论:C6orf37编码区存在一个高度多态性VNTR位点,DHPLC是大规模筛选VNTR多态性的理想方法。

关键词:等位基因多态现象遗传变性高压液相色谱vntr

单位:浙江大学医学院病理研究所; 浙江杭州310031

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