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中国普通野生稻与栽培稻种SSR多样性的比较分析

张晓丽; 郭辉; 王海岗; 吕建珍; 袁筱萍; 彭锁堂; 魏兴华 作物学报 2008年第04期

摘要:采用48对SSR引物对288份我国普通野生稻和栽培稻的遗传多样性进行比较分析。结果显示,共检测到505个等位基因,每个位点的等位基因数变幅为5~20,平均10.5个;平均Nei基因多样性指数(He)为0.731,变幅为0.384(RM409)~0.905(RM206)。普通野生稻遗传多样性高于栽培稻种,栽培稻等位基因数和平均Nei基因多样性指数分别为普通野生稻的70.2%和88.2%,其中,栽培稻地方品种和选育品种等位基因数分别为普通野生稻的65.4%和53.0%,选育品种等位基因数仅为地方品种的81.1%。AMOVA分析表明,总变异的10.3%是由于种间SSR遗传差异所引起的,不同SSR位点种间的分化程度不同,在0.7%~46.3%之间,有43个位点种间遗传分化达到显著水平,其中以RM427分化最为明显,达46.3%。聚类分析表明,中国普通野生稻总体偏粳,极少数广东、海南材料偏籼。

关键词:普通野生稻栽培稻地方品种选育品种遗传多样性

单位:山西农业大学; 山西太谷030801; 中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室; 浙江杭州310006; 广西大学; 广西南宁530004

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