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常见分枝杆菌不同株16S-23S rRNA转录间隔区序列分析

闫李侠 居军 陈保文 祝秉东 王国治 中华结核和呼吸 2008年第06期

摘要:目的分析常见分枝杆菌不同株之间的基因型,为临床分离株的鉴定提供参考序列。方法用16S-23S rRNA转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)序列分析法对94株由德国微生物和细胞保藏中心(DSMZ)引进的常见分枝杆菌进行种内不同株的基因型分析,并分别与12株国际标准株对比。通过种内不同株间同源性序列比对,绘制16S-23SrRNAITS序列聚类分析树状谱,使用DNAStar的MegAlign软件计算株间相似性百分比。结果成功完成上述共106株菌株的16S-23S rRNA ITS测序,发现除胞内分枝杆菌(4株)、鸟分枝杆菌(4株)、海分枝杆菌(6株)和马尔摩分枝杆菌(2株)各有一个基因型且与标准株相同外,其他分枝杆菌均可分为数个不同基因型。结论16S-23S rRNA ITS序列分析可以根据种内各株的不同基因型将分枝杆菌鉴定到株,是分枝杆菌基因型分析的可靠方法。

关键词:分枝杆菌基因型rrna转录间隔区

单位:兰州大学第一临床医学院临床检验诊断学系 730000 甘肃省人民医院检验科 中国药品生物制品检定所菌苗室 兰州大学基础医学院微生物室

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